Periodo Clásico (200–900 d.C.)

La comunidad mantiene relación con centros importantes como Monte Albán, adoptando parte de su organización social y cultural.

Conquista y época colonial (1521–1821)

Con la llegada de los españoles, se introducen nuevas costumbres, religión católica y formas de organización. Se construyen templos y se transforman algunas tradiciones.

Siglo XIX (Independencia de México)

La comunidad se integra al nuevo país independiente, conservando su identidad indígena y sus formas de organización comunitaria.

Actualidad (Siglo XXI)

San Mateo Macuilxóchitl preserva su cultura zapoteca, sus tradiciones y su patrimonio histórico. Destacan sus sitios arqueológicos, su museo comunitario y su identidad cultural viva.

Siglo XX

Se fortalecen las tradiciones locales, como las fiestas patronales, la lengua zapoteca y las actividades agrícolas. Se impulsa la vida comunitaria.